Родился в с. Брдарици в Шабацком крае на западе Сербии. После окончания начальной школы в Драге и гимназии в Шабаце поступил в Белградскую семинарию, которую закончил в июне 1958 г. В сентябре того же года поступил на Богословский факультет Сербской Православной Церкви в Белграде и вскоре был призван на действительную военную службу.

По возвращении из армии по благословению епископа Шабацко-Вальевского Иоанна (Велимировича) принял монашеский постриг, который 3 декабря 1960 г. совершил архимандрит Иустин (Попович) в монастыре Пустиня под Вальево. Будучи собратом монастыря Троноша под Лозницей, продолжил учебу на Богословском факультете. На Богоявление 1961 г. еп. Иоанном рукоположен во иеродиакона. В июне 1963 г. защитил диплом. В этом же году на праздник Успения Пресвятой Богородицы рукоположен в иеромонаха.

По окончании Богословского факультета подал прошение на имя Священного Синода Сербской Православной Церкви о разрешении продолжить образования в Греции и в феврале 1964 г. был направлен Патриархом Германом в Богословскую академию на о. Халка (Турция). В академии иеромонах Афанасий пробыл до июня 1964 г. после чего переехал в Грецию, где на богословском факультете Афинского университета под руководством профессора догматики академика Иоанна Карми написал докторскую диссертацию на греческом языке на тему «Экклесиология апостола Павла по св. Иоанну Златоусту». Защита диссертации состоялась 2 июня 1967 г. После защиты диссертации еще год прожил в Афинах, продолжая научную работу в основном в области патристики. В это же время служил приходским священником в русской церкви в Афинах.

Осенью 1968 г. по благословению своего правящего архиерея отправляется в Париж для дальнейшего продолжения научной работы и изучения французского языка в Свято-Сергиевском богословском институте. Спустя год пребывания во Франции учебным советом института назначен преподавателем курса «Введение в теологию и патрологию с аскетикой». Занимал эту должность в течение трех последующих лет. В последний год своего пребывания в Париже преподавал также Историю Церкви византийского периода. Периодически читал лекции по патрологии на Римо-католическом теологическом факульте (Institut Catholique de Paris) и по византийской литературе в Сорбонне (Hautes Etudes). Служил в русских, сербских, греческих и французских приходах. В качестве представителя Свято-Сергиевского института участвовал в работе I конференции православных богословов в Америке, состоявшейся в Бостоне в сентябре 1970 г.

Летом 1972 г. вернулся в Югославию. Осенью того же года назначен управляющим дома студентов при Богословском факультете. В 1973 г. выбран доцентом на кафедру патрологии (Церковная литература и мысль св. отцов Востока и Запада). Преподавал Историю Церкви. В 1983 г. избран экстраординарным, а в 1987 г. ординарным профессором на кафедре патрологии. Избирался деканом Богословского факультета в 1980-81 и 1990-91 учебных годах. Во время работы на факультете опубликовал около сотни научных работ. Тогда же начал издаваться его труд «Патрология».

Известность получили его публикации в печати, особенно в печатном органе Сербской Церкви «Православие», где он был одним из главных авторов. В своей деятельности уделял особое внимание положению Сербской Церкви и народа в Косово и Метохии и других областях СФРЮ. Принимал активное участие в cборе и подготовке исторических документов о сербских новомучениках.

В 1991 г. Архиерейским Собором СПЦ избран епископом Банатским. Епископская хиротония состоялась 7 июля 1991 г. в Вршце. На Банатской кафедре (Сербия, Воеводина) оставался неполный год. В мае 1992 г. решением Архиерейского Собора СПЦ назначен на Захолмско-Герцеговинскую кафедру (Босния и Герцеговина). Из-за начала активных боевых действий на территории Боснии и Герцеговины настолование в Мостаре, где находилась кафедра, стало невозможным и состоялось в Требинье на Видовдан 1992 г. Епископская кафедра была перенесена туда же в Требинье в монастырь Тврдош, где и находится по сей день. В управление владыке Афанасию досталась епархия, которая на протяжении десятилетий не имела своего епископа и к тому же была охвачена жестокой и кровопролитной войной.

Во время войны владыка Афанасий постоянно оставался со своим народом, сербской армией, посещал военнопленных и беженцев, крестил, проповедовал. Неоднократно выступал с критикой политики Запада, США и мусульманского мира в конфликте на территории бывшей Югославии. Обращался с открытыми письмами к мировым политическим лидерам. В 1994 г. по инициативе владыки Афанасия была открыта духовная академия св. Василия Острожского в Србинье (Республика Сербская, Босния и Герцеговина), первым ректором которой он стал. Его стараниями был устроен перенос мощей свт. Василия Острожского по Герцеговине (10-11 мая 1996 г.).

В 1996 г. в связи с полученной сильной травмой владыка Афанасий попросил Архиерейский Собор освободить его от управления епархией. В сентябре этого же года на заседании Архиерейского Собора отставка была принята, а на его место был назначен епископ Григорий (Дурич). При этом сам епископ Афанасий остался на покое в монастыре Тврдош под Требинье. Епископ Афанасий продолжил научную работу, участвуя во многих научных конференциях, посвященных истории Церкви, философии, богословию и христианской культуре.

Является автором большого количества публикаций в периодической литературе. Вышло в свет более десяти его книг. Член Союза писателей Сербии.

13 февраля 2010 г. решением Священного Архиерейского Синода Сербской Православной Церкви назначен управляющим Рашко-Призренской епархией со всеми правами и обязанностями правящего архиерея. Решением Синода СПЦ от 20 мая 2010 г. освобожден от управления Рашко-Призренской и Косово-Метохийской епархией на основании собственного прошения по состоянию здоровья.