| Иов (первый патриарх) свт., бывший митр. Московский | поставлен с 26.01.1589 по июнь 1605 ; | в заточении; †19.06.1607 |
| Игнатий (самозванец) бывший митр. Рязанский, | поставлен Лжедмитрием с 30.06.1605 по май 1606 | лишен святительского сана и монахом заключен в монастырь |
| Ермоген свт., бывший митр. Казанский и Свияжский, | избран с 3.07.1606 до 1611; | †17.02.1612 (скончался в заточении от голода) |
| Игнатий (самозванец) вскоре (повторно) | поставлен поляками с 1611 по 1612 | бежал в Польшу, где принял унию; † ок. 1640 |
| Межпатриаршество с 1612 по 1619 год В этот период первенствующими митрополитами были: |
| Ефрем митрополит Казанский | с кон. 1612 – нач. 1613; | †26.12.1613 |
| Иона (Архангельский) митрополит Крутицкий (Сарский и Подонский) | с 1614 по 1619 временно заведовал патриаршими делами | |
| Филарет (Романов) бывший митр. Ростовский, | наречен с 29.06.1619; | †1.10.1633 |
| Иоасаф I, бывший архиеп. Псковский, | поставлен с 6.02.1634; | †28.11.1640 |
| Иосиф | интронизован с 27.03.1642; | †15.04.1652 |
| Никон (Минин) бывший митр. Новгородский и Великолукский | возведен с 25.07.1652 по 10.07.1658; | отрекся от патриаршей власти и удалился в монастырь, в 1660 лишен священства, в 1666 простым монахом заточен в Ферапонтов Белозерский монастырь; †17.08.1681 |
| Питирим митр. Крутицкий (Сарский и Подонский) | с 10.07.1658 по 5.08.1664 местоблюститель патриаршего престола; | митр. Новгородский и Великолуцкий |
| Иоасаф II | поставлен с 10.02.1667; | †17.02.1672 |
| Питирим бывший митр. Новгородский и Великолукский | возведен с 7.07.1672; | †19.04.1673 |
| Иоаким(Савелов) бывший митр. Новгородский и Великолукский | избран с 26.07.1674; | †17.03.1690 |
| Адриан бывший митр. Казанский и Свияжский | возведен с 24.08.1690; | †16.10.1700 |
| Далее управление Русской Церковью передано сначала местоблюстителю митрополиту Стефану (Яворскому) с 16.12.1701, а затем, с 1721 года, – Святейшему Синоду. Патриаршество было восстановлено только в 1917 году. |
